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想担心下一次大流行吗?溢出效应。你有报道吗

一项研究合作根据人类风险评估了数百种病毒。

弗朗西维尔跨学科医学研究中心(CIRMF,Centre intersciplinaire Medical de Recherches de Franceville)的研究人员于2020年11月25日在加蓬扎迪地区的一个洞穴内采集蝙蝠样本。
放大 /弗朗西维尔跨学科医学研究中心(CIRMF,Centre intersciplinaire Medical de Recherches de Franceville)的研究人员于2020年11月25日在加蓬扎迪地区的一个洞穴内采集蝙蝠样本。

直到SARS-CoV-2病毒出现在人类身上,我们才知道它。但是以前的经验告诉我们,其他的冠状病毒(SARS和MERS)也会感染人类2019冠状病毒疾病可能会带来风险。冠状病毒在许多与人类频繁接触的物种中普遍存在,它们有明显的适应人类细胞的历史。

了解具有类似特性的病毒可以帮助我们认识到未来大流行的威胁。现在,研究人员正在进行大规模的病毒调查,并发布一个包含数百种病毒的公共数据库,所有这些病毒都被评定为对人类构成多大风险。我们发现的任何病毒都可以插入到研究人员开发的框架中,这样我们就可以快速获得关于它们是否具有威胁性的信息。

外面有什么?

这一努力源于美国国际开发署赞助的一个名为预测这是一系列致力于研究人畜共患疾病的工作的一部分,这些疾病可以跨越物种屏障并感染人类。PREDICT项目总共对动物病毒进行了大规模调查,使用了从75000只动物身上采集的50多万个样本。在这些数据中,该项目发现了700多种新病毒,其中包括一种在发现病毒的动物身上从未见过的病毒。

了解病毒的基因组序列并不能告诉我们病毒单独对人类造成的风险。我们可以弄清楚病毒编码什么蛋白质,但我们无法观察这些蛋白质,弄清楚它们是否使病毒更有可能感染人类。不仅传染性会带来风险。如果一种病毒通常在远离人类的珍稀动物中传播,那么它向我们传播的可能性很小。

各种因素比比皆是,专家们对这些因素的重要性意见不一。因此,弄清楚如何评估新病毒带来了挑战。

为了弄清什么是重要的,研究者们获得了150个病毒学和公共卫生专家来考虑50个不同的潜在危险因素,包括携带病毒的宿主物种,发现物种的位置,以及物种与已知病毒的进化关系。专家们被要求对每一个风险因素的重要性进行排序,预测小组根据每个人在每个问题上的专业知识来权衡每一个评分(例如,病毒学家的意见可能不太适用于与其宿主动物与人类互动频率有关的问题。)

一些一直被高度评价的重要风险因素是显而易见的:与人类和我们的牲畜相互作用的频率、感染多种宿主的能力以及传播方式。并不是每个因素都被认为是非常重要的,有7个因素被认为是重要的。但我们没有足够的数据来正确评估大多数病毒。

得分溢出

最终的结果是一个溢出分数,这是对每种病毒对人类造成的风险的最佳估计,很尴尬地被评为1到155分(这是当你从1到5分的50个因子开始,对它们进行不同程度的权衡,然后将其中的一部分剔除)。为了测试这个系统的有效性,研究人员观察了得分最高的病毒;所有的前十几个已经被知道感染了人类。

SARS-CoV-2正好位于导致非洲多次出血热爆发的两种病毒之间:拉萨病毒和埃博拉病毒。它之所以没有名列前茅,是因为那些其他病毒已经引起了多次疫情(SARS-CoV-2只有一次,但它已经让疫情变得很严重)。我们对其他病毒的正常宿主也有了更多的了解,但在SARS-CoV-2进入人类之前,我们还没有确定它的宿主种类。

所有的分析都可以通过溢出网站,其中包括迄今为止分析的所有病毒的排名列表。对每一种病毒的快速观察将其风险分为三类(基于其所在的宿主、宿主的环境和病毒的基因)。A.详细视图找出我们有足够数据来评估的每个单独因素。

除了提供这些新病毒的数据外,溢出技术还是一个灵活的共享平台。”在这一点上,随着我们进一步了解病毒对人畜共患病的威胁,研究人员承诺他们将更新数据库中所有病毒的分析结果。“分享”是因为PREDICT团队希望研究团体在发现新病毒时加入新的病毒。有可能用六种病毒特性来建立一个风险评分。

虽然追踪这么多新病毒是一个很好的开始,但也有一些明显的局限性。首先,因为流感病毒已经被密集追踪,所以数据库中没有流感病毒。第二,虽然它代表了大量的工作,但这里描述的数百种病毒与感染哺乳动物和鸟类的170万种病毒相比只是杯水车薪。如果我们真的想避免下一次流感大流行向我们袭来,我们还有很多工作要做。

尽管如此,这个项目还是一个有价值的开端。一些以前没有被描述过的病毒被认为比我们已经知道的病毒更具威胁性,这些病毒可以进入人类。显然,针对这些病毒进行研究和更仔细的监测有可能带来巨大的回报,尤其是与COVID-19大流行的全球成本相比。

PNAS,2021年。内政部:10.1073/pnas.2002324118号(关于DOIs).

按列出图像斯蒂芬乔丹/法新社/盖蒂图片社

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