covid变化 -

在巴西发现SARS-CoV-2变种:更具传染性,可能限制免疫力

有些迹象表明它的致死率更高,免疫力降低,但还有很多不确定性。

一大片墓地的鸟瞰图。
扩大 /COVID-19给巴西造成了严重损失。

几乎从它使跳跃到人类的那一刻起,SARS-COV-2病毒一直在挑选突变并在扩展到不同人群时创造新的谱系。实际上,绝大多数这些突变绝对没有区别;得到的病毒具有与其衍生自的未传统形式的特性。

但是有许多案例频率涌现的变体。在大流行早期,这通常是变体的产品进入以前未曝光的人群 - 一个机会而不是病毒的特征。从突变使病毒更危险的情况下分离出这些情况是一个严重的挑战。但本周,一支国际研究人员队发表了证据表明,在巴西首次以其特征在一起的变种可能代表着重要的额外威胁。

细节有很多不确定性,但病毒似乎更传染性,更有可能感染那些对其他病毒株具有免疫力的人,并且它甚至可能更致命。而且,截至何时编写了纸张,血统已在35多个国家发现。

第二波

今年早些时候,我们描述了情况第一波冠状病毒感染重创了巴西城市玛瑙斯。但随之而来的是很长一段时间的低感染率,尽管巴西政府对大流行反应冷淡,这导致一些人认为这座城市可能已经达到了足以提供群体免疫的感染水平。

去年12月,这个充满希望的想法被终结了,当时该市爆发了第二波感染,令医疗系统不堪重负,并导致死亡人数再次飙升。感染率如此之高,令人怀疑可能存在一种新的病毒株,可以逃避第一波感染期间产生的免疫反应。

通过测序导致第二波感染的病毒的基因组,巴西医疗保健工作者对病例的产生作出反应。在该第二波之前,只有七种病毒基因组从亚马逊获得,Manaus所在的状态。新的努力增加了这一数字184年,虽然并非所有这些都是完整的基因组。

基因组显示了一种被研究人员称为P.1的世系的存在,它是第一波病毒中出现的菌株的一个分支。从那以后,P.1发现了大量的突变,包括17个改变了它编码的蛋白质氨基酸序列的个体突变,一个新碱基的插入,以及3个碱基的缺失。这是相当多的变化,表明自3月份以来,基因突变的数量有所增加。时间估计表明,P.1爆发于11月,就在玛瑙斯第二波大规模海啸开始之前。

在第二波病毒爆发的过程中,P.1变异病毒从在样本中无法检测到,在仅仅7周后的样本中就占到了87%。来自巴西其他地方的病毒基因组显示,它也在该国迅速传播,出现在玛瑙斯(Manaus)出发的热门航线上的城市。这表明P.1可能起源于城市。

这是什么?

使用聚合酶链反应(PCR)的病毒检测包括病毒基因组的周期性扩增。因此,如果你从更多的病毒基因组开始,你会在更少的周期内达到可检测的信号水平。这被认为意味着检测病毒所需的周期计数提供了样本来源人携带病毒载量的粗略测量。就P.1菌株而言,试验显示,尽管病毒载量很小,但相当一致。

由于样品在感染后的不同时间出现,因此研究人员无法判断这是否表明病毒的最大程度更高或更长的感染持续时间。也没有特别好。

为了了解P.1可能影响Manaus中的第二波感染,研究人员开发了一种流行病学模型,使他们能够跟踪两种不同的病毒菌株。第一种菌株被设置为SARS-COV-2的典型特性。对于第二种,它们能够调整病毒的性质,例如通过先前感染提供的免疫力及其传播性。这让它们确定哪些属性与Manaus中第二波的动态一致。

总体而言,该模型表明,P.1病毒极有可能比以前的SARS-CoV-2病毒株更具传染性,其传染性可能大约是以前的两倍。也有迹象表明,它可以在某种程度上逃避过去感染所产生的免疫应答。该模型表明,变异病毒至少有10%的机会可以逃避免疫,但可能性不太可能超过50%。

由于P.1菌株感染引起的致死性有些证据。但是,菌株崛起的时间是这样的证据来自医院濒临淹没的时期。所以作者谨慎地对待这种可能性。

是什么导致了这些变化?在P1菌株中发现的突变中,至少有10种会影响病毒的刺突蛋白(spike protein),这种蛋白是病毒用来抓住其感染的细胞的。在病毒株的进化过程中,至少有8种突变被选中,这表明它们有助于提高病毒的传染性。在另一种引起关注的病毒谱系中,也发现了其中的三种具体变化,而且至少有一种已经被证明可以干扰攻击病毒的抗体。

因此,虽然这些数据并不能真正决定性地表明P.1对我们构成了明显的威胁,但它确实与我们的担忧相一致。这也有助于解释为什么玛瑙斯出现了两波截然不同的感染,似乎感染了该市很大一部分人口。然而,正如这篇新论文的作者所指出的,我们还没有完全理解改变抗体靶向蛋白质的突变的后果。在我们掌握这一点之前,我们不会真正知道我们有多担心P.1和其他变体。

科学,2021。DOI:10.1126 / science.abh2644(关于Dois.)。

163年读者评论

  1. *检查日历*

    是我们确定现在不是2020年吗?
    4515帖子|挂号的
  2. 请。每个人。给你疫苗。
    15399个帖子|注册
  3. 引用:
    在该第二波之前,只有七种病毒基因组从亚马逊获得,Manaus所在的状态。新的努力增加了这一数字184年,虽然并非所有这些都是完整的基因组。


    有没有人能解释一下在什么情况下不会出现完整的病毒基因组序列?它可能对这篇文章没有很大的影响或相关性,我只是认为这是一个有趣的信息,可以添加一点额外的背景。
    70个帖子|注册
  4. 是否有一个列出所有“变体”的列表?

    我永远不知道我读的是关于新-新变体的文章还是关于旧-新变体的新研究的文章?
    7582帖子|挂号的
  5. 请。每个人。给你疫苗。


    一场崩溃预示着:巴西的Covid-19疫情让医院不堪重负(纽约时报)

    “当他在去年6月的Covid-19时,Machado先生说,他拿走了总统羟氯喹的抗疟疾药物,他认为他认为”让我活着。“

    Machado先生将有资格在未来几周享受巴西的Covid-19疫苗。但是,即使他被“用棍子殴打”,他也不会得到一个,“马德罗先生说,注意到他最近在线阅读,疫苗比病毒更致命。”

    如果有一个甚至与击中我们的头部远程相似的后世,我希望Bolsonaro,特朗普和其他谎言墓碑在地狱中达到锅炉旁边的房间。
    4827个帖子|注册
  6. 引用:
    在该第二波之前,只有七种病毒基因组从亚马逊获得,Manaus所在的状态。新的努力增加了这一数字184年,虽然并非所有这些都是完整的基因组。


    有没有人能解释一下在什么情况下不会出现完整的病毒基因组序列?它可能对这篇文章没有很大的影响或相关性,我只是认为这是一个有趣的信息,可以添加一点额外的背景。


    排序不是(必然)问题 - 样本收集是。

    一般来说,即使有一个完整的序列,它需要时间来建立共识(因为快速突变部分的自然周期病毒),只有这样你才能看一看差异,然后设计引物,让每个人*其他人*可以说“我们有变量$X”。

    我对复制率的了解(来自内存),

    大肠杆菌每1E5(基因组为500万底,每代50米)。

    艾滋病毒每一代约10k。

    如果有人有关于新冠病毒的可靠数据,我很好奇这是否也会随着变异而改变……

    年代
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  7. nehinks写道:
    是我们确定现在不是2020年吗?

    这是奖励圆。
    23619个帖子|注册
  8. John Timmer,谢谢你这篇相当简洁的更新。
    723帖子|挂号的
  9. dlux写道:
    nehinks写道:
    是我们确定现在不是2020年吗?

    这是奖励圆。


    所有愚蠢都在播放更大的奖品!
    2207帖子|挂号的
  10. 图像
    618个帖子|注册
  11. 只要有大量的人口繁殖新的突变,这将永远不会结束!

    忘了在你的国家周围建一堵墙,给你自己的人民接种疫苗吧。

    这种病毒必须被消灭到地球上最后一个村庄!

    额外成就:消灭普通流感
    133个帖子|注册
  12. 有趣的是,就在几个小时前,我还收到了一些反对和反对暗示的声音,我们不得不期待在未来,由于进化的压力,会有更多的传染性变异。
    872帖子|挂号的
  13. 对拒绝就Covid - 19采取行动的国家实施贸易和旅行制裁。巴西允许病毒不受控制地传播只会让它有更多的变异机会危及我们所有人让这场该死的风暴持续得比需要的时间更长。

    消除贸易以消除“但经济论”
    消除旅行以停止蔓延
    618个帖子|注册
  14. 在我脑海中的真正问题是当我们看到e484k突变存在的变体p.1时。该突变降低了通过疫苗产生的中和抗体反应,以及单克隆抗体疗法,临时血浆和自然感染反应的功效。


    E484K已经呈现了自己的几个变种。在好几个国家都发现了这种病毒。
    1969帖子|注册
  15. 对我来说脱颖而出的一件事是非常幼儿(谁不被原始菌株杀死)现在在巴西的重要数字中死亡。

    为什么巴西有那么多婴儿死于Covid-19 ?

    https://www.bbc.com/news/world-latin-america-56696907
    5962帖子|挂号的
  16. dlux写道:
    nehinks写道:
    是我们确定现在不是2020年吗?

    这是奖励圆。

    除了我们提供批量生产疫苗和技术的供应链,以调整配方。MRNA是高度可调的,如果监管繁文缛节不会阻止它,我们可以短顺出出助推器。
    347个帖子|注册
  17. NeoMorpheus写道:
    这件事情一直在行动越来越多,更像是实验室制作的生物武器。


    不,这不像正常的演变一样。
    872帖子|挂号的
  18. NeoMorpheus写道:
    不是阴谋理论家,但这件事一直在行动越来越多,更像是一个实验室制作的生物武器。


    如果你在设计一种生物武器,难道你不想把变异率降到最低吗?

    毕竟,如果你有一个治疗(疫苗或以其他方式)来保护“你的”公民,你想要的最后一件事就是为了围绕这种治疗变异
    218帖子|挂号的
  19. NeoMorpheus写道:
    不是阴谋理论家,但这件事一直在行动越来越多,更像是一个实验室制作的生物武器。


    当人类留下推推的一切景观,为更多公寓楼和棕榈油种植园腾出空间,曾经生活的动物现在肘部与人类肘部。其中一些人在他们身上有各种各样的精彩事情,可以从他们身上跳到我们身上。而且,甚至没有触及其中一些动物被捕获并吃掉,在这里我们都是。

    “我不是阴谋论者,但我在这里发现了一个关于犹太太空激光的网站……”
    4827个帖子|注册
  20. dlux写道:
    nehinks写道:
    是我们确定现在不是2020年吗?

    这是奖励圆。


    让我们说清楚。它的发音是2020元。

    让它腌有点:-(
    9334帖子|挂号的
  21. 作为一个巴西人,遵循严格的社交距离,使用maks和待在家里,我会敦促你用武力找到我的总统,把他扔在关塔那摩基地某个隐蔽的地方。请把钥匙放在“近”的地方,比如朝鲜的湖泊。

    他是史上最糟糕的总统,他的任务是尽可能地制造最多的死亡人数,希望(从他的观点来看)让民众对主要政党和州长们感到愤怒,这样他在明年的选举中就没有任何可行的竞争对手了。不,我不是在开玩笑,他追随特朗普的步伐,继续朝着将巴西拖至2021年一半死亡人数达到50万的目标前进。

    对于每个措施的专业建立,他的呜呜声和电视说这不是办法,他敦促人们使用HCQ与其他一些药物相结合,在一个被称为套件的Covid上,升上“早期治疗”ou“的预防性治疗“,显然不起作用。

    不要以为你是免疫(双关语)到他的疯狂,他正在将巴西改造为一个非常大的培养皿来创造变形。
    8个帖子|挂号的
  22. mmiller7.写道:
    是否有一个列出所有“变体”的列表?

    我永远不知道我读的是关于新-新变体的文章还是关于旧-新变体的新研究的文章?

    https://en.wikipedia.org/wiki/variants_of_sars-cov-2.

    可能比你想要的信息更多,但是好吧。
    277个帖子|注册
  23. 如果有一个甚至与击中我们的头部远程相似的后世,我希望Bolsonaro,特朗普和其他谎言墓碑在地狱中达到锅炉旁边的房间。

    操作洗车,表面上被认为是反腐败的运动,通过给予国家一位总统,这是一个腐败,愚蠢和无能的荒漠之声,这是一个完全稳定的巴西,而不是只是一个腐败的政治家。
    554帖子|挂号的
  24. motytrah.写道:
    在我脑海中的真正问题是当我们看到e484k突变存在的变体p.1时。该突变降低了通过疫苗产生的中和抗体反应,以及单克隆抗体疗法,临时血浆和自然感染反应的功效。


    E484K已经呈现了自己的几个变种。在好几个国家都发现了这种病毒。


    P.1已经有E484K突变。
    在|注册43个帖子
  25. 开始认真对待这种病毒可以吗?

    来到人们:
    -拿到疫苗
    - 保持佩戴脸覆盖物
    - 避免像瘟疫一样拥挤的室内空间
    1358个帖子|注册
  26. 对拒绝就Covid - 19采取行动的国家实施贸易和旅行制裁。巴西允许病毒不受控制地传播只会让它有更多的变异机会危及我们所有人让这场该死的风暴持续得比需要的时间更长。

    消除贸易以消除“但经济论”
    消除旅行以停止蔓延


    同时取消疫苗的专利,这些专利会阻止贫穷国家生产疫苗。说真的,我不知道现在保护少数几家制药公司的利润是什么意思。他们用税收来开发疫苗,他们已经从最先得到疫苗的发达国家的订单中获得了数十亿美元的利润。难道这还不够吗?现在是时候让所有人和他们的祖母来制造这个东西了。难道我们什么都没学到吗?我们这是在以少数几家公司的季度报告的名义玩火。在一个贫穷的第三世界国家,没有接种疫苗的人将会产生一种真正对疫苗有抗性的突变,我们又来了一次,情况可能会更糟。我们对那些不愿意接种疫苗的人有足够的问题,加上那些愿意但不能接种的人。有人会认为我们已经意识到,传染性呼吸道病毒无论在哪里都不会被控制住,但显然不是这样。

    当然还没有在另一方面游说,因为没有一个人可以减轻整体风险,只有短期收益。整个旅游业和可能的汽车制造商等都应该都要安装一个巨大的运动来释放专利,但没有,他们支付的游说是为了尝试完全尽快打开一切。我们所拥有的短期收益。
    2417个帖子|注册
  27. BullBearMS写道:
    对我来说脱颖而出的一件事是非常幼儿(谁不被原始菌株杀死)现在在巴西的重要数字中死亡。

    为什么巴西有那么多婴儿死于Covid-19 ?

    https://www.bbc.com/news/world-latin-america-56696907


    现在需要重症监护的病例中有40%是不到40岁的年轻人。非常年轻的人现在进入重症监护室的情况很严重,死亡率高于老年人(因为接种疫苗)。

    新的变种更具传染性,更致命,需要更多的重症监护时间,在更短的时间内传播。相比之下,在一个封闭的房间里感染病毒的平均时间是2小时,但现在在P.1是15分钟。

    再加上一个疯狂的总统,现在你知道为什么我们要以尤塞恩·博尔特的速度,奔向50万人的死亡。

    供参考的是,我们确实确认了至少3种其他具有不同程度支配性的变体,包括一种与南非变体相似但更具传染性的变体。

    上帝会帮助我们的,因为总统不会。
    8个帖子|挂号的
  28. velvetglove.写道:
    开始认真对待这种病毒可以吗?

    来到人们:
    -拿到疫苗
    - 保持佩戴脸覆盖物
    - 避免像瘟疫一样拥挤的室内空间

    还有三个半月就要到斯多吉了!

    你所列的每一件事都会被那群人以吵闹的摩托车和中年失败的名义草草抹去。但是,自由将是光荣的!
    23619个帖子|注册
  29. dlux写道:
    velvetglove.写道:
    开始认真对待这种病毒可以吗?

    来到人们:
    -拿到疫苗
    - 保持佩戴脸覆盖物
    - 避免像瘟疫一样拥挤的室内空间

    还有三个半月就要到斯多吉了!

    你所列的每一件事都会被那群人以吵闹的摩托车和中年失败的名义草草抹去。但是,自由将是光荣的!
    你的拼写freedumb不正确…
    15399个帖子|注册
  30. mmiller7.写道:
    是否有一个列出所有“变体”的列表?

    我永远不知道我读的是关于新-新变体的文章还是关于旧-新变体的新研究的文章?


    https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nc ... -info.html.
    3个帖子|挂号的
  31. dlux写道:
    velvetglove.写道:
    开始认真对待这种病毒可以吗?

    来到人们:
    -拿到疫苗
    - 保持佩戴脸覆盖物
    - 避免像瘟疫一样拥挤的室内空间

    还有三个半月就要到斯多吉了!

    你所列的每一件事都会被那群人以吵闹的摩托车和中年失败的名义草草抹去。但是,自由将是光荣的!

    就像德勒瑟在谈到自由时对皮蓬说的那样:“我让你从剩下的一点(服务)中解脱出来。”现在就去吧,你想怎么死就怎么死。”

    *编辑:拼写

    最后编辑velvetglove.2021年4月16日星期五下午12:16

    1358个帖子|注册
  32. ftcsm写道:
    作为一个巴西人,遵循严格的社交距离,使用maks和待在家里,我会敦促你用武力找到我的总统,把他扔在关塔那摩基地某个隐蔽的地方。请把钥匙放在“近”的地方,比如朝鲜的湖泊。

    他是史上最糟糕的总统,他的任务是尽可能地制造最多的死亡人数,希望(从他的观点来看)让民众对主要政党和州长们感到愤怒,这样他在明年的选举中就没有任何可行的竞争对手了。不,我不是在开玩笑,他追随特朗普的步伐,继续朝着将巴西拖至2021年一半死亡人数达到50万的目标前进。

    对于每个措施的专业建立,他的呜呜声和电视说这不是办法,他敦促人们使用HCQ与其他一些药物相结合,在一个被称为套件的Covid上,升上“早期治疗”ou“的预防性治疗“,显然不起作用。

    不要以为你是免疫(双关语)到他的疯狂,他正在将巴西改造为一个非常大的培养皿来创造变形。


    我常想,博尔萨内罗可能是故意这样做的。一种平衡人口收入不平等程度的方法是减少贫困人口。
    459个帖子|注册
  33. 巴西是一个真正的新冠病毒突变的培养皿,因为它几乎不受控制地传播。也许应该颁布旅行禁令,直到他们控制住它。
    |注册帖子324条
  34. kragg写道:
    ftcsm写道:
    作为一个巴西人,遵循严格的社交距离,使用maks和待在家里,我会敦促你用武力找到我的总统,把他扔在关塔那摩基地某个隐蔽的地方。请把钥匙放在“近”的地方,比如朝鲜的湖泊。

    他是史上最糟糕的总统,他的任务是尽可能地制造最多的死亡人数,希望(从他的观点来看)让民众对主要政党和州长们感到愤怒,这样他在明年的选举中就没有任何可行的竞争对手了。不,我不是在开玩笑,他追随特朗普的步伐,继续朝着将巴西拖至2021年一半死亡人数达到50万的目标前进。

    对于每个措施的专业建立,他的呜呜声和电视说这不是办法,他敦促人们使用HCQ与其他一些药物相结合,在一个被称为套件的Covid上,升上“早期治疗”ou“的预防性治疗“,显然不起作用。

    不要以为你是免疫(双关语)到他的疯狂,他正在将巴西改造为一个非常大的培养皿来创造变形。


    我常想,博尔萨内罗可能是故意这样做的。一种平衡人口收入不平等程度的方法是减少贫困人口。

    不知何故,我认为Bolanero有兴趣减少收入不平等的水平。
    1358个帖子|注册
  35. velvetglove.写道:
    kragg写道:
    ftcsm写道:
    作为一个巴西人,遵循严格的社交距离,使用maks和待在家里,我会敦促你用武力找到我的总统,把他扔在关塔那摩基地某个隐蔽的地方。请把钥匙放在“近”的地方,比如朝鲜的湖泊。

    他是史上最糟糕的总统,他的任务是尽可能地制造最多的死亡人数,希望(从他的观点来看)让民众对主要政党和州长们感到愤怒,这样他在明年的选举中就没有任何可行的竞争对手了。不,我不是在开玩笑,他追随特朗普的步伐,继续朝着将巴西拖至2021年一半死亡人数达到50万的目标前进。

    对于每个措施的专业建立,他的呜呜声和电视说这不是办法,他敦促人们使用HCQ与其他一些药物相结合,在一个被称为套件的Covid上,升上“早期治疗”ou“的预防性治疗“,显然不起作用。

    不要以为你是免疫(双关语)到他的疯狂,他正在将巴西改造为一个非常大的培养皿来创造变形。


    我常想,博尔萨内罗可能是故意这样做的。一种平衡人口收入不平等程度的方法是减少贫困人口。

    不知何故,我认为Bolanero有兴趣减少收入不平等的水平。
    我很肯定,情况恰恰相反。
    15399个帖子|注册
  36. A.Felix写道:
    对拒绝就Covid - 19采取行动的国家实施贸易和旅行制裁。巴西允许病毒不受控制地传播只会让它有更多的变异机会危及我们所有人让这场该死的风暴持续得比需要的时间更长。

    消除贸易以消除“但经济论”
    消除旅行以停止蔓延


    同时取消疫苗的专利,这些专利会阻止贫穷国家生产疫苗。说真的,我不知道现在保护少数几家制药公司的利润是什么意思。他们用税收来开发疫苗,他们已经从最先得到疫苗的发达国家的订单中获得了数十亿美元的利润。难道这还不够吗?现在是时候让所有人和他们的祖母来制造这个东西了。难道我们什么都没学到吗?我们这是在以少数几家公司的季度报告的名义玩火。在一个贫穷的第三世界国家,没有接种疫苗的人将会产生一种真正对疫苗有抗性的突变,我们又来了一次,情况可能会更糟。我们对那些不愿意接种疫苗的人有足够的问题,加上那些愿意但不能接种的人。有人会认为我们已经意识到,传染性呼吸道病毒无论在哪里都不会被控制住,但显然不是这样。

    当然还没有在另一方面游说,因为没有一个人可以减轻整体风险,只有短期收益。整个旅游业和可能的汽车制造商等都应该都要安装一个巨大的运动来释放专利,但没有,他们支付的游说是为了尝试完全尽快打开一切。我们所拥有的短期收益。


    当您以成本销售时会发生什么,让其他公司使用“食谱”?问牛津和阿斯蒂尼卡。它已经开始与约翰逊和约翰逊开始。它曾经被称为f.u.d.

    一切都是为了利润。没有别的。这就是所谓的“美国方式”,去他妈的美国和世界其他地方的穷人。这就是为什么美国没有类似的nhs

    请告诉我我错了。
    56帖子|挂号的
  37. 被根除的东西不会变异。现在目标很明确。

    每个人都需要疫苗,尽可能立即接种疫苗。没有这种犹豫不决的东西。我们买不起。
    334个帖子|注册
  38. mmiller7.写道:
    是否有一个列出所有“变体”的列表?

    我永远不知道我读的是关于新-新变体的文章还是关于旧-新变体的新研究的文章?


    几个月前《经济学人》的这篇文章有一个很好的树形图:
    https://www.economist.com/graphic-detail/2021/02/27/the-same-covid-19-mutations-are-appearing-in-different -places.

    图像

    注意精细打印:880个谱系中的36个,包含所有56万个样本中的68%
    (我不得不截屏并重新托管原始图形,因为它是一个文本/图像合成)

    编辑:还添加P.1 Variant在BC中导致很多麻烦。如果将我们的数字与艾伯塔一起进行比较(也处理变体,但看似不同的混合物),BC每天报告略微较少,具有类似的测试积极率(BC为10-11%,艾伯塔省的9.5%)和住院数量,但ICU的案例显着更多。

    最后编辑chanman819周五4月16日,2021年10:49 AM

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